一、判断是否有合理理由
员工长时间未上班，得先看看是不是有合理理由。要是员工因为生病、家里有突发状况等正当原因没办法上班，并且按照公司规定履行了请假手续，那公司就不能随意辞退。比如员工因为患重病住院，向公司提交了医院的诊断证明和请假申请，公司就应该给予理解和支持。但如果员工没有任何合理理由，也不跟公司打招呼就不来上班，那性质就不一样了。
二、查看公司规章制度
每个公司都有自己的规章制度，里面一般会对员工旷工等情况有明确规定。公司得看看自己的规章制度是否合法合规，并且是否向员工公示过。如果规章制度明确规定，员工连续旷工一定天数或者累计旷工达到一定次数，公司可以解除劳动合同，而且这个规定是合法有效的，那公司就有了辞退员工的依据。比如公司规定员工连续旷工15天，公司有权解除劳动合同，员工真的连续旷工15天，公司就可以按照规定处理。
三、遵循法定程序
就算员工长时间未上班符合辞退条件，公司也得遵循法定程序。公司要先书面通知员工，告知其旷工的事实和公司将采取的措施，并且给员工一个解释和申辩的机会。如果员工在规定时间内没有给出合理的解释，公司再做出辞退的决定。比如公司发现员工旷工后，给员工发了书面通知，要求员工在3天内说明情况，员工没有回复，公司就可以进一步处理。
四、保留相关证据
在整个过程中，公司要注意保留相关证据。像员工的考勤记录、请假申请、书面通知等，这些都是很重要的证据。要是以后员工对辞退决定有异议，公司可以用这些证据来证明自己的行为是合法合理的。比如员工说自己请假了，但公司有考勤记录证明其未请假，就能说明问题。
五、支付经济补偿问题
如果员工长时间未上班是因为自身过错，公司按照规定辞退员工，一般不需要支付经济补偿。但如果公司的辞退行为不合法，员工可以要求公司支付赔偿金。比如公司没有按照法定程序辞退员工，员工就可以通过法律途径维护自己的权益。